Dal 1991 opera, presso la Biblioteca Centrale del CNR, la Biblioteca Depositaria della Commissione Europea - DEP - in seguito ad un accordo di convenzione stipulato con la Direzione Generale Informazione, Comunicazione e Cultura della Commissione Europea.
Nel corso del 2006 la Biblioteca Depositaria, in seguito ad un nuovo accordo di convenzione, è divenuta Centro di Documentazione europea (CDE) ed è entrata a far parte di una rete che comprende 600 Centri in tutto il mondo, di cui 366 in Europa e 46 in Italia con lo scopo di promuovere la diffusione dell'informazione comunitaria.
In base alla convenzione, perviene in Biblioteca una copia delle pubblicazioni a stampa ed elettroniche, sia periodiche che monografiche, delle differenti istituzioni dell'Unione (Commissione, Consiglio, Parlamento, Corte di Giustizia, Comitato Economico e Sociale, Comitato delle Regioni, Banca Europea degli Investimenti, EUROSTAT) pubblicate dall'Ufficio delle Pubblicazioni Ufficiali dell'Unione Europea EUR-Op .
Il CDE è dislocato presso la sala B della Biblioteca Centrale "G. Marconi" dove sono messe a disposizione dell'utente numerose banche dati comunitarie e tutte le pubblicazioni, sia periodiche che monografiche, a scaffale aperto. Sono presenti, inoltre, terminali per accedere al sito dell'Unione europea e fare ricerche bibliografiche.
Il CDE costituisce uno dei punti di servizio delle reti di informazione dell'Unione europea.

Le sue principali finalità sono:

• incentivare l'informazione, lo studio e l'acculturamento sulle attività e i valori dell'Unione Europea;
• contribuire, con lo scopo di accrescere la trasparenza, a far conoscere le politiche dell'Unione europea a tutti i cittadini europei (anche esterni al mondo universitario e della ricerca) e alle imprese;
• supportare le università e i centri di ricerca nella promozione e nello sviluppo dell'insegnamento e della ricerca sull'integrazione europea;
• offrire a studenti, studiosi, cittadini provenienti dal mondo del lavoro e delle professioni servizi integrati di informazione e documentazione sulle attività dell'Unione europea, attraverso la consultazione di basi dati e di differenti tipologie di documentazione;
• informare, in sinergia con le altre reti della Commissione, sulle politiche dell’Unione;
• conservare la documentazione provvedendo al suo ordinamento, alla catalogazione, indicizzazione e collocazione;
• diventare un punto chiave d’informazione sulle istituzione e le politiche dell’Unione europea all'interno dell'istituzione opsitante.